ja, es gibt einen InternalFrameListener, oder so ähnlich. Und darin gibt es eine Methode internalFrameIconified(InternalFrameEvent evt) die auf die Minimierung anspringt.
Zum ursprunglichen Anliegen: Die Art und Position wie der minimierte JInternalFrame angezeigt wird glaube ich im L&F festgelegt, d.h. es gibt so direkt keine Methoden das zu beeinflussen.