Hallo,
den Namen der JMS ConnectionFactory kannst du über die Konfigurationsdateien der jeweiligen InvocationLayer angeben:
Verwendest du bespielsweise den UIL2 musst du einfach in der uil2-service.xml den Eintrag:
<attribute name="ConnectionFactoryJNDIRef">ConnectionFactory</attribute>
entsprechend anpassen.
Gruß Tom